Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms