Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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RFTN1Q14699 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFTN1Q14699 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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