Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HNF4GQ14541 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms