Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4AQ14139 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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UBE4AQ14139 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4AQ14139 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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