Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2H2Q13888 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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