Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALCAMQ13740 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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