Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PMS2P11Q13670 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PMS2P11Q13670 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PMS2P11Q13670 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMS2P11Q13670 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms