Protein–RNA interactions for Protein: Q13617

CUL2, Cullin-2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL2Q13617 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL2Q13617 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms