Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
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MKRN4PQ13434 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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MKRN4PQ13434 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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MKRN4PQ13434 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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MKRN4PQ13434 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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MKRN4PQ13434 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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MKRN4PQ13434 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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MKRN4PQ13434 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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MKRN4PQ13434 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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MKRN4PQ13434 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN4PQ13434 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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