Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE3BQ13370 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms