Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLF1Q13351 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF1Q13351 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms