Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA3BQ13214 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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