Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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IFT88Q13099 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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IFT88Q13099 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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IFT88Q13099 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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IFT88Q13099 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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