Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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TRAF1Q13077 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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TRAF1Q13077 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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TRAF1Q13077 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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TRAF1Q13077 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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TRAF1Q13077 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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TRAF1Q13077 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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TRAF1Q13077 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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TRAF1Q13077 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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TRAF1Q13077 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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TRAF1Q13077 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF1Q13077 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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