Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRDNQ13061 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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