Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TROQ12816 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TROQ12816 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TROQ12816 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TROQ12816 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TROQ12816 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TROQ12816 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TROQ12816 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TROQ12816 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TROQ12816 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TROQ12816 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TROQ12816 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TROQ12816 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TROQ12816 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TROQ12816 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TROQ12816 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TROQ12816 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TROQ12816 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TROQ12816 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TROQ12816 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TROQ12816 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TROQ12816 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TROQ12816 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TROQ12816 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TROQ12816 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TROQ12816 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TROQ12816 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TROQ12816 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TROQ12816 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TROQ12816 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TROQ12816 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TROQ12816 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TROQ12816 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TROQ12816 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TROQ12816 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TROQ12816 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TROQ12816 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TROQ12816 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TROQ12816 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TROQ12816 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TROQ12816 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TROQ12816 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TROQ12816 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TROQ12816 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TROQ12816 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TROQ12816 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TROQ12816 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TROQ12816 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TROQ12816 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TROQ12816 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TROQ12816 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TROQ12816 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TROQ12816 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TROQ12816 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TROQ12816 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TROQ12816 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TROQ12816 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
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