Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms