Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms