Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms