Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms