Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ERCC6Q03468 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ERCC6Q03468 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms