Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms