Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPXP78539 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRPXP78539 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRPXP78539 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPXP78539 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPXP78539 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms