Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HBG1P69891 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HBG1P69891 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms