Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms