Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms