Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RND3P61587 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RND3P61587 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RND3P61587 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND3P61587 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RND3P61587 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RND3P61587 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms