Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms