Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPTEP56180 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPTEP56180 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPTEP56180 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPTEP56180 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPTEP56180 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPTEP56180 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPTEP56180 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPTEP56180 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPTEP56180 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPTEP56180 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPTEP56180 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPTEP56180 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPTEP56180 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms