Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCR4P51679 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCR4P51679 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCR4P51679 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCR4P51679 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCR4P51679 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCR4P51679 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms