Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATA4P43694 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATA4P43694 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATA4P43694 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATA4P43694 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GATA4P43694 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATA4P43694 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATA4P43694 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA4P43694 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA4P43694 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA4P43694 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms