Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCAMP43121 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCAMP43121 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCAMP43121 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCAMP43121 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCAMP43121 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCAMP43121 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MCAMP43121 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCAMP43121 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCAMP43121 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCAMP43121 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCAMP43121 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MCAMP43121 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCAMP43121 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCAMP43121 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MCAMP43121 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCAMP43121 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MCAMP43121 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCAMP43121 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCAMP43121 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCAMP43121 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCAMP43121 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCAMP43121 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms