Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms