Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZEB1P37275 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms