Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFHR2P36980 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms