Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCGF2P35227 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCGF2P35227 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms