Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFNP31947 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFNP31947 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFNP31947 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms