Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMBRP28336 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMBRP28336 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMBRP28336 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMBRP28336 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms