Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5F1P24539 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms