Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B4P23634 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms