Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KB1P23443 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms