Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERBB3P21860 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms