Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCL3P20749 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCL3P20749 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCL3P20749 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCL3P20749 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms