Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms