Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDSP20132 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDSP20132 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDSP20132 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDSP20132 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDSP20132 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDSP20132 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDSP20132 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SDSP20132 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDSP20132 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDSP20132 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDSP20132 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDSP20132 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SDSP20132 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SDSP20132 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDSP20132 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDSP20132 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDSP20132 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SDSP20132 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDSP20132 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDSP20132 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDSP20132 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDSP20132 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDSP20132 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDSP20132 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSP20132 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSP20132 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDSP20132 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDSP20132 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDSP20132 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDSP20132 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDSP20132 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDSP20132 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms