Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL2P13500 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL2P13500 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL2P13500 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL2P13500 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL2P13500 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL2P13500 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL2P13500 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL2P13500 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL2P13500 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL2P13500 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL2P13500 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL2P13500 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL2P13500 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL2P13500 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL2P13500 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms