Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGAP10645 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHGAP10645 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGAP10645 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGAP10645 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGAP10645 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms