Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms