Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CBSLP0DN79 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms