Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms